Tradycje orkiestry sięgają roku 1945. Bezpośrednią poprzedniczką zespołu jest działająca od 1974 Gdańska Orkiestra Symfoniczna (roku przemianowano na Orkiestrę Filharmonii Bałtyckiej). Obecnie filharmonicy gdańscy należą do wiodących orkiestr w Polsce. PFB współpracowała z wybitnymi światowymi zespołami, dyrygentami i solistami, m.in.: Filharmonicy Moskiewscy, Deutsche Kammerphilharmonie Bremen, Sinfonia Varsovia, Sinfonietta Cracovia, Sir Neville Marriner, Paavo Järvi, Maxim Vengerov, Krzysztof Penderecki, Krystian Zimerman, Cyprien Katsaris, Nigel Kennedy, Konstanty Andrzej Kulka, Rafał Blechacz, Soyoung Yoon. Orkiestra PFB zagrała m.in. koncert z udziałem Jeana-Michela Jarre’a z okazji 25-lecia powstania Solidarności i podpisania Porozumień Sierpniowych (2005); „Siedem bram Jerozolimy” Krzysztofa Pendereckiego w ramach koncertu z okazji 75-urodzin kompozytora pod jego batutą (Sekcja Dęta Orkiestry, 2008); War Requiem B. Brittena (dyr. Sir Neville Marriner) w ramach festiwalu Solidarity of Arts (2009).
W roku 2014 Orkiestra odbyła tournée po Chinach (siedem koncertów), a w 2016 r. wyruszyła w najdłuższe w historii tournée po Stanach Zjednoczonych, grając tam 43 razy. Z okazji 70-lecia działalności PFB muzycy zagrali w Moskwie i Sztokholmie. Orkiestra zarejestrowała wiele nagrań, m.in. „Wybitni twórcy polscy: Henryk Wieniawski” (2016) z udziałem Maxima Vengerova, płytę „Bacewicz/Szostakowicz” (2016) z Aleną Baevą, „Kulka / Karłowicz / Lipiński” (2020) z udziałem Konstantego Andrzeja Kulki oraz „PALESTER dzieła nieznane” (2021).
